Microscoapele cu lumină și microscoapele electronice diferă unele de altele. Comparați variațiile termenilor similari.
Un microscop optic poate vedea doar structuri celulare specifice, cum ar fi pereții celulari, cloroplastele, cromozomii marcați, mitocondriile, nucleele etc., în timp ce un microscop electronic poate observa toate structurile celulare. Pentru a spune simplu, un microscop cu lumină poate dezvălui structura microscopică a unei celule, în timp ce un microscop electronic poate dezvălui compoziția sa submicroscopică.
Mărirea este distincția principală. Indiferent cât de mult zoom este folosit, microscoapele optice au o mărire maximă dincolo de care ochiul uman nu poate discerne. y(min)=0,61*lungime de undă / (n*sinu) Maximul este de aproximativ 1,5 chiar dacă n*sinu este scufundat în ulei, iar cantitățile rămase depind de mărimea lungimii de undă. Prin urmare, mărirea este inutilă, deoarece mărirea maximă a unui microscop optic este de aproximativ 1000 de ori. Deoarece lungimea de undă a fasciculelor de electroni utilizate în imagistica cu microscopul electronic este semnificativ mai mică decât cea a luminii vizibile, acestea pot rezolva detalii minuscule, permițând măriri de până la câteva milioane.
